Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo

Resumen

En el presente trabajo se describe el uso de procedimientos bioinformáticos e información genómica de acceso libre por Internet, para identificar y caracterizar proteínas que participan en la defensa de Mycobacterium tuberculosis (MT) frente al estrés oxidativo, con el propósito de obtener nuevos blancos farmacológicos en este patógeno. Las secuencias de aminoácidos de las proteínas correspondientes a los genes katG, ahpC, ahpD, sodA, sodC y mgtC fueron comparadas con el genoma de Mycobacteríum tuberculosis H37Rv a través del servidor del National Center for Biotechnology Information, determinando su posible redundancia en el genoma. Paralelamente, se obtuvo información sobre sus residuos más conservados evolutivamente por alineamiento múltiple global usando el programa MAXHOM, así como modelos de sus estructuras tridimensionales usando los métodos de «modelaje molecular comparativo» a través del servidor SWISS-MODEL o modelaje por el método de «reconocimiento de plegamiento» (threading) a través del metaservidor GENESILICO. En base al análisis genómico se puede concluir que las proteínas codificadas por los genes katG, ahpD y mgtC son buenos candidatos como blancos farmacológicos debido a que no tienen similaridad significativa con alguna proteína codificada por genes presentes en el genoma humano y no presentan redundancia en el genoma del Mycobacterium tuberculosis.