Revista Peruana de Biología

Minería de datos de secuencias de DNA enviadas a bases de datos genéticas públicas por instituciones peruanas

2021-02-25T23:53:19-05:00

La diversidad genética es una componente importante de la biodiversidad y es crucial para los esfuerzos actuales de proteger y gestionar de manera sostenible varios organismos y hábitats. Hasta donde sabemos, solo hay un trabajo que describe la información genética peruana almacenada en bases de datos públicas. Nuestro objetivo fue actualizar este trabajo previo buscando en cuatro bases de datos públicas que almacenaban información de secuencias digitales: Nucleotide, BioProject, PATRIC, BOLD. Con esta información analizamos la contribución de las instituciones peruanas durante los últimos años. En Nucleotide, la base de datos más grande, las bacterias fueron los organismos más secuenciados por las instituciones peruanas (70.60%), las bacterias patógenas como Pasteurella multocida, Neisseria meningitidis y Vibrio parahaemolyticus fueron las más abundantes. No encontramos registros de secuencias del dominio Archaea. En BioProject, la secuencia más común pertenece a Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis. En PATRIC, una base de datos de agentes patógenos, Mycobacterium tuberculosis y Yersinia pestis tuvieron el mayor número de entradas. Finalmente, en BOLD, una base de datos exclusivamente eucariota, Chordata (Aves y Actinopterygii), Angiospermae y Arthropoda (Insecta y Arachnida) fueron los registros más frecuentes. Nuestros resultados indicarían las preferencias de investigación de las instituciones peruanas, centrándose en enfermedades infecciosas y algunos filos eucariotas. Aunque ha habido un aumento significativo de la información de ADN enviada por las instituciones peruanas desde el último informe, la diversidad genética reflejada en estas bases de datos sigue siendo inconsistente con la diversidad del país. Se deben realizar más esfuerzos para obtener información genética de grupos taxonómicos más subestimados y promover más investigación genética en las instituciones regionales peruanas.

Polimorfismos de nucleótido simple (PNSs) del gen MC1R en alpacas negras y marrones

2021-02-25T23:53:21-05:00

En alpacas los fenotipos del color de vellón tienen diferentes terminologías que induce a una confusión dentro del color marrón y sus tonalidades, el que requiere de una mejor descripción y cuantificación. En consecuencia los objetivos del estudio fueron cuantificar el color de fibra e identificar los PNSs informativos del gen MC1R (receptor 1 de melanocortina) en alpacas marrones y negras. Un fenotipo vicuña (n=14) y cuatro fenotipos de alpacas (n=79), marrón claro, marrón oscuro, marrón-negro y negro fueron evaluados por colorimetría. El vellón de vicuña mostró mayor luminosidad (47.74) e intensidad de color (24.33) respecto a las alpacas marrones. Los valores obtenidos de CIE L*a*b* (luminosidad e intensidad) sugieren valores bajos en alpacas eumelánicas y altos en alpacas feomelánicas. En vicuña y alpaca la secuencia codificante del gen MC1R tiene un solo exón de 954 pb, las vicuñas no mostraron la deleción (c.224_227del). Sin embargo, esta deleción se ha observado en los tres fenotipos de alpaca (marrón claro, marrón oscuro y negro), al igual que los cinco PNSs no sinónimos que ya fueron descritos en otras poblaciones, c.82A>G, c.259G>A, c.376G>A, c.587T>C, c.901C>T (p.T28A, p.M87V, p.G126S, p.F196S y p.R301C). Para las dos especies, se identificaron un total de ocho haplotipos definidos por los cinco PNSs. No se observaron asociaciones entre los fenotipos de color y los PNSs: c.259G>A, c.376G>A y c.901C>T (p>0.05), probablemente debido a la influencia de otros genes como el ASIP en la expresión del color. Nuestros resultados, así como los estudios previos evidenciaron regiones altamente conservadas en la secuencia codificante del gen MC1R.

Análisis genómico comparativo de dos nuevos plásmidos de la cepa PQ33 de Acidithiobacillus ferrivorans

2021-02-25T23:53:23-05:00

Acidithiobacillus ferrivorans es un acidófilo psicrotolerante capaz de hacer crecer y oxidar sustratos ferrosos y sulfurosos a bajas temperaturas. Hasta la fecha se han caracterizado seis genomas de este organismo; sin embargo, la evidencia de un plásmido en esta especie ha sido informado solo una vez, por lo que no hay un rol concluyente de los plásmidos en la especie. Aquí, dos plásmidos novedosos de A. ferrivorans PQ33 se caracterizaron molecularmente y se compararon a escala genómica. Se secuenciaron y anotaron los genomas de dos plásmidos (12 kpb y 10 kpb) de A. ferrivorans PQ33 (NZ_LVZL01000000). Los plásmidos, denominados pAfPQ33-1 (NZ_CP021414.1) y pAfPQ33-2 (NZ_CP021415.1), presentaron 9 CDS y 13 CDS, respectivamente. El análisis in silico mostró proteínas involucradas en la conjugación (TraD, MobA, Eep y XerD), sistemas de toxina-antitoxina (HicA y HicB), replicación (RepA y proteína de unión al ADN), regulación de la transcripción (CopG), chaperona DnaJ y un gen de virulencia (vapD). Además, los plásmidos contienen secuencias similares a las porinas selectivas de fosfato O y P y una proteína diguanilato ciclasa-fosfodiesterasa. La presencia de estos genes sugiere la posibilidad de transferencia horizontal, un sistema regulador de mantenimiento de plásmidos y adhesión a sustratos para especies de A. ferrivorans y PQ33. Este es el primer informe de plásmidos en esta cepa.

Aislamiento e identificación de bacterias proteolíticas, amilolíticas, lipolíticas y quitinolíticas de residuos de langostinos

2021-02-25T23:53:25-05:00

Las bacterias y enzimas microbianas son biocatalizadores y pueden ser usadas como alternativa en los procesos químicos industriales. El presente estudio se centró en aislar e identificar cepas bacterianas a partir de desechos de langostinos, capaces de producir amilasas, lipasas, proteasas y quitinasas, que tuvieran potencial aplicación en el tratamiento de residuos de langostinos. Se aisló treinta y dos cepas bacterianas, caracterizadas fenotípicamente e identificadas mediante el sistema API 20 y mediante análisis molecular basado en el ADNr 16S. Se encontró que el 28.13% de las cepas bacterianas aisladas tenían capacidad amilolítica, 87.50% lipolítica, 96.88% proteolítica y 28.13% capacidad quitinolítica en placas de agar con sustratos específicos. Los géneros identificados fueron Bacillus, Burkholderia, Ochrobactrum, Vibrio, Pseudomonas y Shewanella. Las bacterias con capacidades enzimáticas aisladas en el presente estudio, podrían ser usadas para obtener subproductos de los desechos de langostinos, así como en otras aplicaciones industriales.

Evaluación del potencial de Desmodesmus asymmetricus y Chlorella vulgaris para la remoción de nitratos y fosfatos de aguas residuales

2021-02-25T23:53:27-05:00

En este estudio evaluamos las microalgas Chlorella vulgaris y Demodesmus asymmetricus, con el fin de determinar la proporción de microalgas que remueven la mayor concentración de nitrógeno y fósforo en aguas residuales de una planta de tratamiento. Se realizó un diseño de mezclas de las microalgas con el agua residual durante 9 días, con fotoperiodo 12:12 h, en un invernadero. Las mayores eficiencias de remoción de nitrógeno (principalmente NO₃^--N y NO₂^--N) y fósforo (PO₄^3-) se observaron en los tratamientos con mayor proporción de D. asymmetricus, entre ellos sobresalió el tratamiento T3 (25% C. vulgaris / 75% D. asymmetricus) donde se removió el 100% de nitrógeno y 77.1% de fosforo. De igual manera con el oxígeno disuelto (OD), el T3 obtuvo el mejor resultado alcanzando una media de 10.90 ± 0.60 mg/L. Finalmente, de acuerdo con el análisis del diseño de mezclas, se determinó que la mezcla óptima de microalgas que logra la mayor producción de OD y la mayor remoción, fue la proporción de 6% de C. vulgaris y 94 % de D. asymmetricus en un tiempo de cultivo de 9 días. En conclusión, las microalgas demuestran su capacidad de biorremediación de aguas residuales domésticas.

Análisis exploratorio sobre conflictos fauna silvestre-gente en la Reserva Natural Tumbesia La Ceiba, área núcleo de la Reserva de Biosfera Binacional Ecuador-Perú "Bosques de Paz"

2021-02-25T23:53:29-05:00

Los conflictos entre fauna silvestre y seres humanos constituyen un problema complejo y creciente, principalmente para la conservación de especies involucradas en los mismos. Pese a la existencia de trabajos que analizan esta temática en el neotrópico, aún se evidencian vacíos de conocimiento geográficos y/o temáticos sobre esta disciplina. Ecuador, alberga un importante número de estudios enfocados principalmente en la identificación de las especies involucradas en conflictos. Sin embargo, la costa del país; particularmente los bosques secos del suroccidente han permanecido al margen sobre el tema. Este estudio se desarrolló en las comunidades circunscritas a la Reserva Natural Tumbesia La Ceiba, cantón Zapotillo, al sur de Ecuador. Con el uso de una entrevista semiestructurada, aplicada a los pobladores del sector se logró identificar, categorizar, definir la frecuencia, causas, y actitudes sobre los conflictos con la fauna silvestre del sector. Se identificaron seis tipos de conflictos: cacería, depredación de animales domésticos, destrucción de cultivos, usos medicinales, tráfico de especies y ofidiofobia. Dieciséis especies están involucradas en esta problemática. Puma concolor y Lycalopex sechurae se proponen como las especies más conflictivas. Además, se identificó una respuesta comunitaria organizada para enfrentar los problemas causados por las especies; así como se encontró que los costos causados por ataques de fauna silvestre son significativos, principalmente cuando involucran la pérdida de ganado caprino. Este trabajo provee la línea de base respecto al conocimiento de este campo investigativo para el sur occidente del país y evidencia que la única forma de enfrentar la problemática es establecer formas de colaboración público-privadas.

Revisión del conocimiento actual y conservación de la lechuza de los arenales Athene cunicularia (Molina, 1782) en el Perú

2021-02-25T23:53:29-05:00

La lechuza de los arenales Athene cunicularia (Aves: Strigidae) se distribuye desde Canadá hasta Tierra del Fuego en América. Ocupa una gran variedad de hábitats naturales, ambientes urbano-rurales y agroecosistemas. En el Perú residen tres subespecies A. c. nanodes, (Berlepsch y Stolzmann, 1892), A. c. juninensis (Berlepsch y Stolzmann, 1902) y A. c. cunicularia (Moliln, 1782). El presente trabajo, constituye una revisión de la bibliografía complementada con datos propios, con la finalidad de identificar el estado actual del conocimiento de la biología y estado de conservación de A. cunicularia con especial énfasis en las poblaciones que habitan en el Perú.

Diversidad ictiológica de la quebrada Mayapo, Amazonia Peruana

2021-02-25T23:53:30-05:00

El presente estudio reporta la diversidad ictiológica de la quebrada Mayapo en base a material depositado en la Colección Ictiológica del Museo de Historia Natural de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos (MUSM), en los años 2005, 2009 y 2010, proveniente de 30 puntos de muestreo de la quebrada Mayapo y afluentes ubicados entre los 256 y 557 m de altitud. Se identificaron 60 especies agrupadas en 39 géneros, 16 familias y cuatro órdenes, siendo los órdenes Characiformes y Siluriformes y las familias Characidae y Loricariidae los grupos más representativos. La diversidad de especies fue moderada, en comparación a otras evaluaciones en la Amazonia peruana. La composición taxonómica siguió el patrón predominante en aguas continentales de la Región Neotropical y en la Amazonia peruana. Se registraron especies de importancia pesquera, hábitos migratorios y distribución restringida.

Comunidades vegetales del matorral desértico en las cuencas de los ríos Tambo y Moquegua en el sur de Perú

2021-02-26T21:59:14-05:00

Se presenta un estudio sobre la composición florística, clasificación fitosociológica, ecología y bioclimatología de las comunidades vegetales de los ambientes desérticos en las cuencas de los ríos Tambo y Moquegua en el Departamento de Moquegua, ubicado al sur de Perú a una altitud que varía entre los 1350 y 3200 m s.n.m. Se realizaron 94 levantamientos fitosociológicos en campo siguiendo la metodología de Braun-Blanquet adaptada por Montesinos, se aplicaron los softwares TWINSPAN 2.3 para clasificar la vegetación y CANOCO 4.5 para el análisis de DCA con variables ambientales. En la clasificación bioclimática se siguió la metodología de Rivas-Martínez. Como resultados se registran 181 especies de flora, de las cuales 32 son endémicas y 121 son nativas. El análisis y clasificación de la vegetación dan como resultado la descripción de tres asociaciones, 5 subasociaciones nuevas y dos comunidades dentro de la nueva alianza Ambrosio artemisioidis-Weberbauerocerion torataensis perteneciente al orden Oreocereo leucotrichi-Neoraimondietalia arequipensis y clase Opuntietea sphaericae. Se halló dos pisos bioclimáticos tropicales: Termotropical y Mesotropical en combinación con cuatro niveles de humedad u ombroclimas: Ultrahiperárido, Hiperárido, Árido y Seco. La vegetación de los ambientes áridos al sur de Perú puede llegar a ser muy variada y restringida a sus cuencas hidrográficas, siendo dependientes de condiciones húmedas extraordinarias que permiten deducir la importancia de conservar estos ecosistemas desérticos.

Distribución y conservación de Cactaceae en Bosques Tropicales Estacionalmente Secos: apreciaciones a partir de estudios florísticos y fitosociológicos

2021-02-27T11:40:12-05:00

Las listas de especies presentadas en trabajos florísticos o fitosociológicos proporcionan importante información sobre distribución, útil para realizar inferencias biogeográficas y evaluar el estado de conservación de especies o incluso de ecosistemas. En el caso de los bosques secos del nordeste de Brasil, conocidos como Caatinga, el análisis de esas listas puede contribuir para confrontar ideas previamente establecidas sobre la homogeneidad de esa unidad de vegetación. La fuerte relación entre el sustrato y los ensambles de plantas de la Caatinga pueden caracterizar distintos tipos de vegetación. Es así como, el objetivo de este trabajo es evaluar sí la distribución de Cactaceae está relacionada con los tipos de sustrato (sedimentar y cristalino), sea con la riqueza florística o la densidad de las especies. Al mismo tiempo, evaluamos el estado de conservación de las áreas estudiadas de la Caatinga. Los datos fueron obtenidos a partir de revisiones bibliográficas, de estudios de florística y fitosociología en la Caatinga. Para evaluar las distintas áreas, con los estudios florísticos seleccionados se preparó una matriz de similaridad. Se encontró que, 48 áreas tenían especies de Cactaceae; 33 especies distribuidas en 14 géneros fueron listadas. Cereus jamacaru fue la especie con el mayor número de puntos en 17 áreas, seguido por Pilosocereus gounellei (=Xiquexique gounellei), encontrado en 11 estudios y Tacinga inamoena, en 10. El análisis resultó en la formación de 10 grupos con fuertes relaciones entre especies y tipos de sustratos. También, encontramos diferencias en diversidad de especies en relación con el estado de conservación de la Caatinga, notable por las relaciones directas entre conservación y riqueza de especies, e indirectas entre densidad y número de especies.

Ampliación del rango de distribución del pecho de luna del Marañón (Melanopareia maranonica) en la cuenca media del río Marañón, Perú

2021-02-25T23:53:20-05:00

Reportamos registros documentados de la ampliación del rango de distribución del Pecho de Luna del Marañón (Melanopareia maranonica) en seis localidades. Estas tienen conectividad hidrológica con la cuenca media del río Marañón, en las provincias de Celendín (Cajamarca) y Luya (Amazonas), Perú. Los registros fueron obtenidos mediante encuentros ocasionales, evaluaciones biológicas y búsqueda intensiva, entre el 2017 y 2020. Los nuevos registros están entre los 1111 y 2074 m, superando en más de 1000 m su rango altitudinal conocido. Se registraron un total de 39 individuos (11 hembras, 12 machos y 16 indeterminados debido a que solo se hizo registro auditivo). Ampliamos el rango conocido respecto a los registros publicados en 121 km en la región Cajamarca y 98.2 km en la región Amazonas. Se protege hábitat apropiado para la especie en 5290.12 ha del ecosistema Bosque Estacionalmente Seco Interandino del Marañón y 7784.67 ha de Matorral Andino, en tres Áreas de Conservación Privada y un Área de Conservación Regional. Los datos de presencia ayudarán a comprender de mejor forma la distribución de la especie y los ecosistemas que ocupa.

Primer registro de Scapholeberis freyi Dumont and Pensaert, 1983 (Crustacea:Anomopoda: Daphniidae) en Colombia

2021-02-25T23:53:22-05:00

A partir del análisis de las muestras de plancton de una charca temporal al noreste de Colombia algunos especímenes hembra del cladócero daphnido Scapholeberis freyi Dumont and Pensaert, 1983 fueron colectados. Este representa el primer reporte en Colombia y expande su rango distribucional conocido en Sur América. Los especímenes observados se describen y se comparan con los datos morfológicos disponibles de sus congéneres más cercanos. Una descripción breve de este taxón basado en el material colombiano es dada.

Estudio preliminar de los Arctiinae (Lepidoptera: Erebidae) del departamento de Arequipa, Perú

2021-02-25T23:53:24-05:00

Se presenta una lista preliminar y la diagnosis de las especies de Arctiinae de Arequipa. Se propone a Amastus pallescens como nuevo sinónimo de Amastus cellularis. Por primera vez se da a conocer la hembra de A. cellularis. Se revalida la especie Magnoptera watsoni, que fue sinonímizada hace pocos años con Amastus walkeri. Se recolectó durante el 2017-2018, en 16 estaciones de evaluación que comprendieron 4 rangos altitudinales: 0-1500, 1500-2500, 2500-3500, 3500-4500 m.

Registro de coloración anormal del oso hormiguero norteño Tamandua mexicana (Saussure, 1860) y notas sobre su límite sur de distribución

2021-02-26T22:03:58-05:00

Presentamos el registro de un individuo de oso hormiguero norteño (Tamandua mexicana) con color de pelaje anormalmente blanco. Este individuo fue fotografiado con una cámara trampa en el bosque seco ecuatorial en el departamento de Lambayeque, a 560 m de altitud, en del noroeste del Perú. No pudimos diferenciar si la causa de esta aberración cromática correspondió a un caso de albinismo o de leucismo, sin embargo, destacamos este primer registro excepcional para la especie en Perú. Adicionalmente, hacemos una revisión de su presencia en el extremo sur de su distribución global.

Thysanoteuthis rhombus Troschel, 1857 (Teuthida: Thysanoteuthidae) calamar diamante, registro en la zona costera de Ica, Perú

2021-02-25T23:53:28-05:00

En el presente trabajo a través de la pesca artesanal se registra por primera vez Thysanoteuthis rhombus en el litoral de Pisco y se amplía su rango de distribución en el pacífico oriental hasta Ica, Perú. Un ejemplar de 68 cm LM fue capturado entre los 13°50’00” S y 77°08’00” W a 50 metros de profundidad. Se realiza una breve descripción de la especie, con observaciones taxonómicas y comentarios sobre su distribución geográfica y pesquería.