Protocolo de extracción de ADN de alta calidad para estudios genómicos en caballos peruanos

Resumen

Actualmente es posible caracterizar genéticamente razas de caballos peruanos como el Caballo Andino, el Caballo Morochuco y el Caballo Peruano de Paso mediante genotipado por secuenciación (GBS). Esta metodología requiere ADN de alta calidad. La extracción de ADN de caballos a partir de sangre es un proceso invasivo. El objetivo del estudio fue estandarizar un método de obtención de ADN de alta calidad para estudios genómicos en caballos a partir de pelos de la cola y crin. Se colectó pelo y sangre de 10 yeguas criollas de la región Amazonas para evaluar cuatro cantidades de folículos pilosos (T1=80, T2=60, T3=40, T4=20) y 200 μl de sangre. Se extrajo el ADN genómico y se analizó la cantidad, calidad e integridad de ADN obtenido mediante espectrofotometría y electroforesis en gel de agarosa, respectivamente. La calidad se evaluó además mediante la amplificación por PCR del gen COX1. Se evidenció una distribución normal de los datos de concentración (ng/μl) obtenidos. El mejor tratamiento para la obtención de ADN fue T1, con concentraciones promedio de 22.99 ng/μl y ratios 280/260 y 260/230 de 1.84 y 1.76, respectivamente. La concentración y pureza del ADN es óptima según los parámetros requeridos por las plataformas de secuenciación. La cantidad de ADN obtenido a partir de sangre fue mayor; sin embargo, la metodología de colecta de pelo no es invasiva y el transporte y almacenamiento no requiere de una condición especial a diferencia de otros tejidos como la sangre.