XML JATS in scientific publishing: (dis)encounters between Markup and Marcalyc
DOI:
https://doi.org/10.15381/dds.n13.28075Keywords:
XML JATS markup, Markup, Marcalyc, scientific journals, digital publicationAbstract
This article examines, through user experience, two XML JATS markup tools for scientific articles: SciELO Markup and Marcalyc from Redalyc. The objective is to show the differences or similarities between each of these technological developments. This is achieved through a comparative analysis that focuses on four key points: 1) conception of the tool, 2) applied methodology, 3) communities or organizations that use it, and 4) implications. The analysis concludes that the markup task is influenced by technological tools that adhere to different science logics and models of communication. The study contribution lies in uncovering the importance of preserving XML JATS as a standard and interoperable language that facilitates dialogue among information systems, by reducing the effort and editorial work for scientific journals in the Latin American region.
References
Aguado-López, E., Becerril-García, A. y Leonardo-Valentín, E. (2024). Manual de usuario Marcalyc versión 4.0. Sistema de Información Científica Redalyc.
Aguado-López, E. y Becerril-García, A. (2017, 2 de junio). Carta pública dirigida al director de SciELO Abel L Packer. y colegas para acordar la conciliación en los sistemas de marcación. XML-JATS Redalyc en R2020 [blog]. https://n9.cl/mf3li
Anglada, L. (2021, 2 de junio). Si no lo paga nadie, ¿quién lo paga? Las Infraestructuras de la Ciencia Abierta. Blok de BiD [blog]. https://n9.cl/zumqcc
Arcila, J. (2024, 18 de abril). Inteligencia artificial y programación XML-JATS [video conferencia]. Entrelibro-Arba Scientific Publishing Group. YouTube. https://www.youtube.com/watch?v=FoMWPPfJcQo
Aréchaga, J. (2012). The International Journal of Developmental Biology. En Manual de buenas prácticas en edición científica (pp. 21-25). FECYT. https://n9.cl/acpve
Arunav, M. (2022, 4 de enero). How JATS XML Can Positively Impact Publishers. Scispace. SciSpace [blog]. https://n9.cl/rxhci1
Banzato, G y Rozemblum, C. 2019. Modelo sustentable de gestión editorial en AA en instituciones académicas: principios y procedimientos. Palabra Clave, 8(2), e069. http://dx.doi.org/10.24215/18539912e069
Banzato, G., Rozemblum, C. y Chávez-Ávila, S. (2022). Ni ángel diamante, ni demonio APC. Diversidad de modelos de gestión y financiación en las revistas científicas iberoamericanas en AA. Informatio, 27(1), 113-141. https://doi.org/10.35643/info.27.1.8
Barret NR. (1962). Publish or perish. Journal of Thoracic Cardiovascular Surgery. 44:167-79. https://doi.org/10.1016/S0022-5223(19)32970-8.
Becerril-García, A., Aguado-López, E. y Macedo-García, A. (2023). Marcalyc: software para la marcación XML JATS para las revistas científicas de AA diamante. Palabra Clave, 12(2), e179. https://n9.cl/spl5bq
Bosman, J., Frantsvåg, J.-E., Kramer, B., Langlais, P.-C. y Proudman, V. (2021). OA Diamond Journals Study. Part 1: Findings. Science Europe y cOAlition S. https://n9.cl/r63o6
Cristiani-Sienra, A. (2016). Journal Article Tag Suite (JATS): situación actual y análisis de implantación del estándar promovido por NISO para revistas científicas basado en XML [trabajo de fin de máster]. Universidad Carlos III de Madrid.
Collective of feminist and social justice editors (2020, 15 de julio). After Open Access. Critical Legal Thinking [blog]. https://n9.cl/ksjv6
Correa, L. y Chiarullo, F. 2019. LuXMeL: hacia la interoperabilidad Redalyc/AmeliCA-SciELO. Palabra Clave, 9(1), e075. https://doi.org/10.24215/18539912e075
Cumbre Global sobre Acceso Abierto Diamante (2023). Manifiesto sobre la Ciencia Abierta como Bien Público Global: Acceso Abierto No Comercial. https://n9.cl/bn6o0
Declaración de Berlín sobre el Acceso Abierto (2003). Berlin Declaration on Open Access to Knowledge in the Sciences and Humanities. https://n9.cl/8cbni
Declaración de Bethesda (2003). Declaración de Bethesda sobre Publicación de Acceso Abierto. https://n9.cl/2lslc
Declaración de Budapest (2002). Iniciativa de Budapest para el Acceso Abierto. Budapest Open Access Initiative (BOAI). https://n9.cl/4lxm3
De Moya-Anegón, F. (2020). Función de las revistas científicas [prólogo]. En T. Baiget, Manual SCImago de revistas científicas. Creación, gestión y publicación (pp. 10-17). Ediciones Profesionales de la Información SL (EPI). https://n9.cl/2lu0x
DORA (2012). San Francisco Declaration on Research Assessment. https://sfdora.org/read/
FOLEC (2019). Foro Latinoamericano sobre Evaluación Científica. https://www.clacso.org/folec/
Gil Leyva, I. (2022). Posibilidades del xml jats para el tratamiento y la recuperación de información: El caso del sistema de indización automática SISA. En C. Naumis Peña, y A. A. Rodríguez García (Coords.). La investigación bibliotecológica y de la información hacia el 2030: desarrollo sostenible. Universidad Nacional Autónoma de México. https://n9.cl/p36o13
Guédon, J. C. (2021). La historia de la forma de la revista a través del prisma de la historia de la “gran conversación científica”. Revista IUS, 15. https://doi.org/10.35487/rius.v15i0.2021.784
JATS4R Group (2018). JATS4R. JATS for reuse [blog]. https://jats4r.org/
Lujano Vilchis, I. (2021). Los editores de revistas latinoamericanas de educación: reflexiones sobre sus roles en la investigación educativa y en el sistema de publicación académica. Revista del IICE, (50), 147-162. https://doi.org/10.34096/iice.n50.11270
National Center for Biotechnology Information (NCBI) (2013). JATS: Journal Article Tag Suite. U. S. National Library of Medicine. https://jats.nlm.nih.gov
Packer, A. y Gomes, L. G. (2023). SciELO MarketPlace – plataforma de comercialización de productos y servicios de comunicación científica. SciELO en Perspectiva [blog]. https://n9.cl/bc0n6
Packer, A., Salgado, E., Araujo, J., Aquino, L., Almeida, R., Santos, J., Lucena, S. y Soares, C. M. (2014, 4 de abril). ¿Porqué XML? SciELO en perspectiva [blog]. https://n9.cl/xz274
Packer, A. (2014, 28 de abril). SciELO Citation Index en el Web of Science. SciELO en Perspectiva [blog]. https://n9.cl/u2b9u0
Pilloni-Martínez, L. (2020). Condiciones laborales de los editores de revistas científicas en México. Aspectos de la precariedad en el trabajo académico. 4° Congreso Internacional y 2 Iberoamericano de Revistas Científicas. COMESCO.
Poynder, R. (2023, 7 de diciembre). Where Did the Open Access Movement Go Wrong?: An Interview with Richard Poynder (Anderson). The Scholarly Kitchen [blog]. https://n9.cl/1eng5k
Poynder, R. (2019). Open access: Could defeat be snatched from the jaws of victory? Digital Commons. https://n9.cl/uk0h4
Redalyc [@Redalyc] (2023, 2 de junio). Conoce los nuevos términos de uso de #Marcalyc, siempre disponible, para revistas de #AccesoAbierto no comercial. X [Twitter]. https://n9.cl/1mc3sq
Redalyc (2021). Contribución de Redalyc en la profesionalización del editor de revistas científicas en cuanto al uso del XML JATS. Redalyc en R2020 [blog]. https://n9.cl/2ep7d
Redalyc (2021a). Flujo de trabajo editorial usando la infraestructura tecnológica de Redalyc/AmeliCA basada en el XML JATS. Redalyc en R2020 [blog]. https://n9.cl/w6gct
Redalyc (2016). ¿Qué es XML? Redalyc en R2020 [blog]. https://n9.cl/0xydhi
Rodríguez-Yunta, L. y Tejada-Artigas, C. M. (2013). El editor técnico: un perfil necesario para la profesionalización de la edición de revistas científicas en el entorno digital. Anales de Documentación, 16(2), 1-9. http://dx.doi.org/10.6018/analesdoc.16.2.17639
Rönnau, S. y Borghoff, U. M. (2009). Versioning XML-based office documents. Multimed Tools Appl, 43, 253-274. https://doi.org/10.1007/s11042-009-0271-2
Rozemblum, V. (2021). Propuesta de implementación de marcado XML-JATS para revistas científicas sostenidas por la Universidad Nacional de La Plata [tesis de grado]. Universidad Nacional de La Plata. https://n9.cl/jtkls
Salatino, M. y López-Ruíz, O. (2021). El fetichismo de la indexación. Una crítica latinoamericana a los regímenes de evaluación de la ciencia mundial. Revista Iberoamericana de Ciencia, Tecnología y Sociedad, 16(46), 73-100.
Sánchez Pereyra, A. [ScieloMéxicoOficial] (2017, 7 de abril). Respuesta pública de SciELO México a RedALyC sobre 6 de abril de 2017. Facebook. https://n9.cl/eoruq
Scholarly Kitchen (2017, 17 de octubre). JATS4R: Optimizing the Reusability of Scholarly Content. Scholarly Kitchen [blog]. https://n9.cl/cma6u9
SciELO Brasil (2024). Empresas con Atestado de capacidad técnica para servicios de marcación de textos de acuerdo con SciELO Publishing Schema (SciELO PS). https://n9.cl/yjb4r
SciELO México (2024). Preparación de archivos. Manual de marcación por SciELO México. https://n9.cl/qhani
SciELO México (2024a). Certificación y empresas de servicios de marcación textos SciELO publishing schema. https://n9.cl/9l5x4
SciELO México (2024b). Cotizador precios conversión XML JATS SPS. https://n9.cl/hcq0x
SciELO (2023). Declaración sobre el uso de Contribuciones al Costeo de Publicaciones (CCPs) en la Red SciELO. https://n9.cl/3wxlt
UNESCO (2023). Reforzar las infraestructuras científicas abiertas para todos. Kit de herramientas de ciencia abierta de UNESCO. https://doi.org/10.54677/GRVV7394
Useche-Guzmán, E. y Contreras-Rodríguez, F. (2016). Sustentabilidad de las iniciativas latinoamericanas de publicación de revistas científicas en AA utilizando el estándar XML JATS: el caso de SciELO. Biblios: Revista electrónica de bibliotecología, archivología y museología, (64), 15-32.
World Wide Web Consortium (W3C) (2016, 11 de octubre). Extensible Markup Language (XML). https://www.w3.org/XML/
Zetter-Patiño, J. (2018). Estandarización XML-JATS. Un modelo para la publicación en acceso abierto. Cuarto Congreso Nacional y Segundo Congreso Iberoamericano de Revistas Científicas. Universidad Autónoma de Aguascalientes, Universidad Nacional Autónoma de México. https://n9.cl/rfvgv
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